贝利亚军团覆灭后，赛罗奥特曼组建“终极赛罗警备队”，计划重访艾美拉娜公主。队员詹伯特先行出发时被人工星球比特星捕获，赛罗等人展开救援，途中遇见潜入星球的雷与日向船长。比特星以消灭有机生命体为目标，内部存在大量机器人军团及被控制的詹伯特、钢铁杀手等敌人。众人协同作战，突破危机并揭露幕后黑手，最终解救被困同伴并终止星球计划。

■STAGEI「鋼鉄の宇宙」 ウルトラマンゼロ・グレンファイヤー・ミラーナイト・ジャンボットで結成された“ウルティメイトフォースゼロ”と、かつて共に冒険を繰り広げたエメラナ姫との 再会は、謎の巨大人工天球の猛威によって引き裂かれた。天球はエメラナ姫の宇宙ヨットとジャンボットを内部に捕えると、別の宇宙へと転送消滅して しまう。 一方、天球が転送された先の宇宙では、ＺＡＰのレイとヒュウガ船長が休暇のために目指していた惑星ブラムの目前に突如出現した謎の天球の調査に 赴いていた。天球の内部に潜入した二人がそこで見たものは、歴代ウルトラマン達を苦しめたメカロボット達の姿だった。この人工天体は、謎の“ビート スター”からの命令により、あらゆる宇宙のバトルロボを吸収し、最強のメカロボット軍団を作り出して「有機生命体の抹殺」を企てる鋼鉄の天球なのだ。 その天球内部に時空を超えて駆け付けるウルトラマンゼロ達。 だが、そこにジャンボットに酷似した最強メカロボット、“ジャンキラー”が出現！ロボット軍団と共にゼロ達の前に立ちはだかった…。 ■STAGEII「流星の誓い」 謎の天球で行方不明になっていたジャンボットと再会を果たすエメラナ姫。だが、ジャンボットはそのエメラナ姫に刃を向ける。一方のゼロたちもジャンキラーの猛攻に阻まれ、 身動きが取れずにいた。傷ついたリトラをかばい、ジャンボットが振りかざしたバトルアックスの前に立ちはだかるエメラナ姫。 「やめなさい」、姫の声に動きを止めるジャンボット。そして、それに倣うかのように何故かジャンキラーの動きまでもが一瞬停止するが、即座に機能を回復させて何処かへと飛び 去ってゆく。エメラナ姫の導きによりジャンボット内部に潜入したレイとヒュウガはそこでロボットたちを操る謎の天球ガーディアン、“ビートスター”の存在と、ジャンキラーが ジャンボットのデータをベースにビートスターが作り上げたロボットである事を知る。ビートスターは何故、ロボットたちによる有機生命体の抹殺を企てているのか？ 刻一刻と惑星ブラムへと迫る天球。惑星衝突の危機迫る中、 ウルティメイトフォースゼロの前に再びジャンキラーが出現！容赦ない攻撃の前に、ついにエメラナ姫は…。

詹伯特为了保护艾美拉娜公主被人工星球囚禁在星球内部。赛罗奥特曼、红莲火焰还有镜子骑士为了救他们也进入到了这个人工星球内部。在人工星球移动的过程中，被雷和日向撞见，于是雷和日向也进入到了这个星球内部。 这个人工星球叫比特星。星球内部为空洞，星球的中心有人造太阳，在其公转轨道上有月球。星球内的外壳内壁上有未来建筑物的废墟，再向内部延伸有岩石山体与干涸的海床。星球内部没有人，比特星穿梭各个宇宙，它出现的地方会发生重力异常。比特星在内部造了大量的机器人军团，其目的是抹杀一切有机生命体。 赛罗他们为了救出困在里面艾美拉娜公主，而与机器人军团相遇。不过非常糟糕的是，詹伯特被比特星球控制，甚至还出现一台非常厉害的机器人钢铁杀手，连赛罗奥特曼都难以招架。要想救出被困的公主还有钢铁武士，众人必须找出幕后黑手才能阻止这一切。

ZAP SPACY收到了求救信号，雷等人迅速驾驶盘龙号前往，但却被吸进扭曲空间。在扭曲空间的一颗惑星上，雷他们遇见了其他次元的自己，并且出现了一头机械哥莫拉。 原来在这个星球上，莎乐美星人正在进行秘密试验，令所有次元的联系都集结在一起。雷召唤哥莫拉迎战机械哥莫拉不敌，正当危急之际，赛罗奥特曼出现营救。而为了计划的继续进行，莎乐美星人启动了黑暗独眼巨人赛罗。

赛罗奥特曼为了救盘龙号的船员，与黑暗洛普斯赛罗展开了激烈地战斗。在战斗过程中，由于赛罗一个不小心被打入了扭曲的空间里，在这个扭曲的空间里，赛罗居然遇到了奥特兄弟，只不过没想到的是，奥特兄弟居然对赛罗发动了攻击。原来这些奥特兄弟并不是真正的奥特兄弟，是一群人造的冒牌货。赛罗虽然无惧这些冒牌的奥特兄弟，但是由于对方人数较多，赛罗一时间也是陷入了苦战 冒牌奥特兄弟不断对赛罗发动攻击，赛罗的体力渐渐开始不支了。就在千钧一发之际，雷欧奥特曼现身，特地赶来支援赛罗。在雷欧的帮助下，赛罗与雷欧合力击败了冒牌奥特兄弟。击败冒牌奥特兄弟，赛罗马上逃出扭曲的空间，赶回去支援盘龙号的船员们。 从扭曲空间逃出来的赛罗再次与黑暗洛普斯赛罗交手。而日向船长终于查明了这件事的来龙去脉，这一切的背后都是一位叫海洛蒂亚的萨罗梅星人搞得鬼。她企图造出宇宙机器人军团，征服整个宇宙。可惜，有些东西根本不是海洛蒂亚能够掌控的。黑暗洛普斯赛罗的失控，宣布了海洛蒂亚的计划彻底失败。

钢铁武士为了保护艾美拉娜公主被人工星球囚禁在星球内部。赛罗奥特曼、火焰战士还有镜子骑士为了救他们也进入到了这个人工星球内部。在人工星球移动的过程中，被雷和日向撞见，于是雷和日向也进入到了这个星球内部。 这个人工星球叫比特星球。星球内部为空洞，星球的中心有人造太阳，在其公转轨道上有月球。星球内的外壳内壁上有未来建筑物的废墟，再向内部延伸有岩石山体与干涸的海床。星球内部没有人，比特星球穿梭各个宇宙，它出现的地方会发生重力异常。比特星球的在內部造了大量的机器人军团，其目的是抹杀一切有机生命体。 赛罗他们为了救出困在里面艾美拉娜公主，而与机器人军团相遇。不过非常糟糕的是，钢铁武士被比特星球控制，甚至还出现一台非常厉害的机器人钢铁杀手，连赛罗奥特曼都难以招架。要想救出被困的公主还有钢铁武士，众人必须找出幕后黑手才能阻止这一切。

被莎乐美星人抓到的雷，得到了“异次元的雷”的帮助。 然而异次元的雷却无法控制雷奥尼克斯的血脉，进入失控状态。 另一方面，由于与假奥特兄弟的激战，赛罗奥特曼陷入了绝境。 关键时刻到来的是赛罗的老师雷欧奥特曼！ 等待丽和日向的命运是什么！？黑暗独眼赛罗的秘密即将揭开！

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